Окончил (1980 г.) Первый Московский медицинский институт
им. И.М. Сеченова, где в дальнейшем работал (1980-2012 гг.).
Кандидат медицинских наук (1985 г.), доктор медицинских наук (2001).
С 2013 г. — генеральный директор ФБГНУ «Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов
им. М.П. Чумакова РАН» Минобрнауки России. С 2017 г. — заведующий кафедрой организации и технологии производства иммунобиологических препаратов ФГАОУ ВО Первого МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России.
Избран член-корреспондентом РАН по Отделению медицинских наук (специальность «Организация фармации») (2016 г.).
Под руководством А.А. Ишмухаметова разработана уникальная методология производства информационно-аналитических систем, отражающих актуальное состояние фармацевтической отрасли. Она включает в себя новейшие методики обработки статистической информации и алгоритмы экстраполяции данных, адаптированные к особенностям фармацевтического рынка. Создание принципиально нового аналитического контента, дающего возможность многофакторного анализа и научного прогнозирования экономических явлений на фармацевтическом рынке, позволяет более эффективно решать проблемы отрасли. Сформулированы и обоснованы основополагающие принципы создания единой информационной среды в сфере обращения лекарственных средств.
В 2014 г. предложил и реализовал концепцию развития Центра
им. М.П. Чумакова, позволившую соединить научные, технологические и производственные аспекты создания и введения в сферу обращения оригинальных инновационных отечественных иммунобиологических препаратов, таких как вакцины для профилактики полиомиелита, клещевого энцефалита, желтой лихорадки, которые включены в национальный и региональные Календари профилактических прививок. Была проведена реорганизация бизнес-процессов предприятия с введением принципов управления качеством на биофармацевтических предприятиях. Это позволило в кратчайшие сроки полностью модернизировать предприятие, получить сертификат GMP, решить задачи импортозамещения, разработать новые биофармацевтические и иммунологические препараты, часть из которых уже прошла доклинические и клинические исследования. В результате предприятие увеличило объем выпускаемой продукции и экспорт препаратов.
