Родился 22 января 1975 года в Ярославле. В 1997 году окончил факультет «Информатика и вычислительная техника» Ярославского государственного университета им. П.Г. Демидова по специальности «математик-системный программист».
В 1998-2000 гг. работал в ЯФ АКБ «СбС-АГРО»; занимался проектированием и развитием мультисервисных сетей для оказания банковских услуг. С 2000 по 2012 годы работал в региональных и московских ИТ-компаниях — занимал руководящие позиции в ИТ-компаниях: АФК «Система» и «Альфа-групп». Имеет опыт руководства в международных компаниях.
В 2012 году Лысенко пригласили возглавить Департамент информатизации и связи Правительства Ярославской области. В 2015 г. назначен вице-губернатором региона. В этой должности курировал развитие ИТ и вопросы региональной безопасности.
В ноябре 2016 г. в ранге заместителя руководителя Департамента информационных технологий города Москвы возглавил направление ведомственной информатизации и взаимодействия с федеральными органами власти.
В апреле 2018 года Лысенко назначен Первым заместителем руководителя ДИТ города Москвы.
С 21 сентября 2018 года назначен министром Правительства Москвы, руководителем Департамента информационных технологий города Москвы.
