Яненко А.С. является директором НИЦ «Курчатовский институт» — ГосНИИгенетика.
Основным научным направлением исследований Яненко А.С. является разработка биотехнологий на основе ферментации возобновляемого сырья и биокатализа, поиск и конструирование новых биокаталитических систем микроорганизмов для использования в органическом синтезе и медицине, а также в технологиях защиты окружающей среды. Яненко А.С. является автором свыше 70 публикаций в этой области.
Под руководством Яненко А.С. выполнен большой цикл работ в области энзиматической конверсии нитрильных соединений, в частности, по созданию уникальных биокатализаторов на основе микробных ферментов для получения акриловых мономеров. Эти катализаторы нашли широкое применение в химической индустрии России и за рубежом, где используются крупнейшими химическими компаниями мира (Degussa, Германия, Asahi Kasei, Япония, Europolimeri S.p.A., Италия и др.) для производства акриловых мономеров на основании лицензионных соглашений. Вклад Яненко А.С. в разработку промышленных биокатализаторов и создание первого биотехнологического производства в химической индустрии России (г. Пермь) отмечен Премиями Правительства РФ в 1995 г. и 2010 г. В последние годы важнейшим направлением работы является создание штаммов-продуцентов аминокислот и разработка технологии изготовления лизина на основе продуктов переработки зерна.
20 научных разработок, выполненных под руководством Яненко А.С. признаны изобретениями и охраняются патентами России, США, Германии, Южной Кореи и других стран. Они посвящены биотехнологиям получения акриловых мономеров, биокаталитическому синтезу L-аспарагиновой кислоты, созданию бактериальных препаратов для очистки воды и почвы от нефтяных загрязнений.
Яненко А.С. являлся научным руководителем важнейшего инновационного проекта государственного значения, финансируемого Минобрнаукой. В течение последние 5 лет также являлся руководителем 3 проектов в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 — 2020 годы», а также 3 грантов РФФИ, гранта РНФ.
Научные исследования, выполняемые под руководством Яненко А.С., проводятся в тесном сотрудничестве с ведущими научными центрами, такими как Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова, Национальный центр по биотехнологии (Брауншвайг, Германия), Центр морских исследований (Мессина, Италия), Тель-Авивский университет (Израиль), а также с научными центрами ведущих биотехнологических компаний — Центром по биокатализу компании Degussa и компании Stockhausen (Германия), EuroPolimeri (Италия), Tong Sah Petrochemical Inc. (Республика Корея) и др.
А.С. Яненко является членом Программных и Организационных комитетов ряда конференций, конгрессов и школ для молодых ученых (Московский биотехнологический конгресс, ЕвразиаБио, Школа молодых ученых по молекулярной генетике и др.).
А.С. Яненко является членом нескольких Советов по защите диссертаций (ГосНИИгенетика, Институт микробиологии РАН, МГУ им. Ломоносова).
А.С. Яненко является Лауреатом Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники за работу «Промышленный метод биокаталитического получения акриламида и полимеров на его основе» (1996 г.);
Лауреатом Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники за работу «Разработка и промышленное освоение биокаталитической технологии производства L-аспарагиновой кислоты и инновационных лекарственных препаратов на основе ее солей» (2011 г.)
Лауреатом Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники за работу «Разработка и промышленное освоение технологии микробного синтеза незаменимой аминокислоты лизина — важнейшей кормовой добавки для животноводства на основе продуктов глубокой переработки зерна» (2018 г.)
