Е.Ф. Синельникова является автором более 100 научных работ по истории российских научных обществ первой трети XX в. , в том числе 3 монографий («Научные общества Петрограда-Ленинграда в 1920-е гг.» (СПб., 2023), «Самоорганизация российской науки в годы кризиса: 1917-1922» (СПб., 2020, в соавторстве с Э.И. Колчинским), «Санкт-Петербургское философское общество (1897-1923)» (СПб., 2020 (в соавторстве с В.С. Соболевым)) и 23 коллективных монографий и сборников научных статей, в которых она является автором глав и статей, ответственным редактором, редактором-составителем. Е.Ф. Синельникова участвует в подготовке научных и научно-педагогических кадров, являясь научным руководителем аспиранта, а также читая курсы «Источниковедение истории науки и техники» и «Историография науки и техники» для аспирантов, обучающихся в Санкт-Петербургском филиале Института истории естествознания и техники им. С.И. Вавилова Российской академии наук. Е.Ф. Синельникова является заместителем председателя Организационного и Программного комитетов Международной научной годичной конференции Санкт-Петербургского отделения Российского национального комитета по истории и философии науки и техники РАН.
