Директор НИИ Трансляционной медицины Российского национального исследовательского медицинского университета имени Н.И. Пирогова, заведующий отделом Геномики адаптивного иммунитета Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, заведующий лабораторией геномики адаптивного противоопухолевого иммунитета Приволжского исследовательского медицинского университета, сооснователь и научный директор компании MiLaboratory LLC.
Коллектив Чудакова Д.М. использует современные молекулярные технологии и биоинформатические методы для задач высокопроизводительного анализа репертуаров Т-клеточных рецепторов и антител человека и модельных животных. Проведена серия работ по фундаментальным исследованиям адаптивного иммунитета. В том числе, исследованы закономерности формирования и развития Т-клеточного иммунитета и его изменений в ходе старения. Показана уникальная способность долгоживущих грызунов сохранять разнообразие репертуара Т-клеточных рецепторов на протяжении всей жизни. Исследованы новые функциональные подтипы регуляторных Т-лимфоцитов, изучена их биология. Впервые показана полноценная адаптивная природа гамма-дельта Т-лимфоцитов. Продемонстрирована важнейшая роль экспрессируемых в контексте опухолевого микроокружения олигоклональных вариантов IgG1 антител в противоопухолевом иммунитете при меланоме. Совместно с центром Дмитрия Рогачева, изучена динамика восстановления Т-клеточного иммунитета при гаплоидентичной аллогенной трансплантации T-деплецированных клеток крови. Открыты консенсусные варианты Т-клеточных рецепторов характерные для болезни Бехтерева — потенциальные мишени для терапии аутоиммунного заболевания. Совместно с компанией Биокад, получено терапевтическое антитело для терапии болезни Бехтерева и HLA-B27-ассоциированного псориатического артрита, успешно проведены первые доклинические исследования, планируются клинические исследования 1 фазы. Коллективом опубликовано более 120 научных работ, в том числе в таких ведущих мировых журналах как Nature, Nature Medicine, Nature Immunology, Nature Biotechnology, Nature Methods, Immunity, Leukemia, Physiological Reviews, и других.
